保护饮用水水源是保障饮用水安全的第一道关，农业水资源与农业生态环境保护、实现农业可持续发展也尤为重要。污水灌溉、工业废水排放、农业投入品的流失、农村生活污水等都对农业水资源及环境造成了影响。

　　近年来，普洱市积极开展农业污染源普查，实施乡村清洁工程示范及生态村建设及无公害农产品产地认证。农业污染源普查通过摸清种植业、畜禽养殖业和水产养殖业生产过程中产生的污染物种类、产生量、排污量、排放量及其去向，为农业环境污染防治及农业政策的制定提供决策依据。建立了农业污染源档案和信息数据库，根据对污染数据的分析，普洱农业污染源状况属于良性阶段，未造成大的破坏。

　　大力推广生态农业技术，促进农业生产和生活方式转变，从根本上改变农村脏乱差的局面和耕作力下降问题。建立健全村规民约，对村民进行无公害蔬菜种植技术、科学养猪技术培训，建设生活污水处理池、垃圾房、分类垃圾箱等，使村容村貌得到明显改善。合理施用农药、化肥，加强源头管理。禁止施用禁用、滥用农药，大力推广测土配方，每年确保实施360万亩。

　　目前，已完成了5个县的无公害农产品产地认定整体推进，组织20余家企业认定无公害基地。全市无公害基地认定面积已达282.1万亩，推行农业标准化建设，以达到抓好饮用水源、灌溉水源的保护，加大对农业面源污染的治理和管理力度。