南水北调东线工程从江苏省扬州附近的长江干流引水，利用京杭大运河以及与其平行的河道输水，连通洪泽湖、东平湖等，并作为调蓄水库，经泵站逐级提水进入东平湖后，分别向黄河北和胶东地区供水。黄河以北供水线路，在聊城市东阿县刘集镇位山村附近，通过倒虹吸工程穿过黄河，利用小运河，经东阿县、阳谷县、东昌府区、开发区、茌平县进入临清市，在临清城区东部扩挖六分干，北输至临清城北的蛤蜊屯村，进入德州市。
    南水北调东线在聊城市境内全长110公里，设计过水流量为50立方米/秒，每年向聊城市供水1.8亿立方米。工程竣工通水后，聊城市将在调引黄河水的基础上增加长江水，届时将有更稳定的水源。
    拟建9座储水水库
    长江水途经聊城市，怎样“挽留”这些水资源，以便更好地缓解聊城市水源短缺的局面呢？据聊城市南水北调工程建设管理局负责人介绍，南水北调输水干线距离用水区远，送水时间为每年的10月至11月和第二年的4月至5月，配套工程是必需的，即建设连接管线和9座平原水库。有了这9个“大水缸”后，全市各县市将都有机会“喝”上长江水。
    聊城市配套工程各县（市、区）采用了独立建水库方案，全部工程主要包括180公里输水管线和总库容8400万立方米的9座平原水库，规划概算投资48亿元。投资来源主要由用水的8个县（市、区）自筹。目前，配套工程规划已经完成并上报。
    232户搬迁为施工让路
    按照要求，南水北调东线工程山东段必须在2012年底完成主体工程，2013年率先实现通水。根据省南水北调建管局工作安排，聊城市必须在2011年1月30日前完成小运河输水工程全部移民征迁工作，确保施工企业无障碍进场。小运河输水工程需征地1.8万亩，其中永久占地1万亩，临时占地8000亩，拆迁房屋3.5万平方米，涉及6个县（市、区）的19个乡镇，138个村，搬迁232户，872人。另外还涉及铁路、公路、电力、通讯等大量专项设施。