合作协议旨在共同防范江西、广东跨省流域水污染问题，共同应对和处置跨省突发水污染事件，切实保障水生态环境安全，建立健全同水共责、协同合作、有序有效应对突发水污染事件应急联动工作机制。两省建立了“4+N”的协作机制，4个主体机制分别为建立联合协作机制、研判预警机制、科学应对机制、后期处置机制，每个主体机制中又包含多个小的合作机制，涵盖跨省流域突发水污染事件事前、事中、事后处置全过程。