“十一五”成为“九五”以来重点流域水污染防治工作成效最显著的5年。一是规划项目完成情况总体较好。“十一五”规划的项目完成率比“十五”提高了22.8个百分点，是“九五”以来的3个五年重点流域水污染防治规划中项目完成率最高的。二是城镇污水处理设施建设成绩突出。截至2010年年底，全国重点流域范围内累计建成城镇污水处理厂1595座，污水处理能力达到6796万立方米/日，分别是“十五”末的3.8倍、2.2倍，高于全国平均增长水平。三是水环境质量明显改善。与2005年相比，2010年重点流域国控断面中，Ⅰ～Ⅲ类水质断面比例从2005年的24.4％上升为44.2％，劣Ⅴ类水质断面比例从36.4％下降为25.8％，高锰酸盐指数的年均值下降了35.9％。四是主要污染物减排成效显著。到2010年年底，重点流域主要污染物化学需氧量的排放量较2005年下降了15.3％，完成规划确定减排任务的1.3倍。