南京民间环保组织的专家经历4年跟踪调查，近日绘出了莫愁湖的生态图谱：尽管目前周边空气质量达到了国家一级标准，但莫愁湖水质却在逐渐恶化。李耀东教授是莫愁环保协会的带头人，他和一群热心的居民四年来一直关注着莫愁湖的变化，3月份，他们刚刚进行了例行的水质采样。李耀东教授介绍，南京市环保部门逢单月监测莫愁湖水质，他们就双月监测，两方一合，一年的水质数据就有了。

　　李耀东教授：“它污染一直在加重，环境质量缓慢降低，07年我们测COD化学耗氧量，07年15、16毫克升，08年20，09年30，10年达到40，这条曲线是往上升的，但是这条曲线很缓慢。”

　　经过对莫愁湖水质、底泥、污染源等综合检测和调查，李耀东教授发现，导致水质变化的最主要原因是莫愁湖与秦淮河的地下通道被阻断了，湖水失去了自净能力，此外，莫愁湖已经有25年没有清淤，影响了水质。

　　李耀东教授的检测报告记录了莫愁湖水质点滴的变化，这份动态的水质报告也为南京市相关部门进行湖水治理打了重要的基础。从2007年开始，莫愁湖边滨湖街道的居民相继做了莫愁湖土壤、植物种类和鸟类调查。他们发现，莫愁湖一共有植物225种、鸟类45种，第一次摸清了莫愁湖公园的植物、鸟类家底。

　　李耀东教授介绍，他们在调查中还意外的发现了莫愁湖上一个尚未开发的无名小岛，60多年来保持着原生态，他们也建议相关部门对这样的珍贵生态资源划定红线，永不开发：“从来没有开发，因此我们上去发现路都没有。周围的一圈树都是长出去的，船都靠不上去，原生态状态。这个我们发现以后在报告里提到，这个是南京人民最宝贵的教材，为什么，城中之湖人流密集，它居然会出现原生态的环境，非常宝贵。”